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農作物病毒檢測儀在農業上的應用，是為了起到早防治的作用，我們知道，如果在植物發病初期就能診斷其病害情況，那么相對來說，防治起來就要簡單很多，而如果等作物表現除了病害特征，在出防治的話，那么無疑防治難度會大很多。

近年來，借助農作物病毒檢測儀研究作物病害情況，我們發現，要想做好植物病害的防治，要做到預防為主，防治相結合。比如做好預防，首先需要殺滅傳播病毒的害蟲，即刺吸式口器的害蟲，從而截斷傳播的介質。殺蟲劑如吡蟲啉、吡蚜酮、噻蟲嗪、烯啶蟲胺等，對刺吸性口器的害蟲都有很好滅殺效果。其次要控制病毒繁殖，需要用藥劑來削弱病毒的活性和鈍化病毒。植物體內本身含有病毒，是否發病，要看病毒的活性和病毒繁殖的數量，當病毒活性增強，病毒的數量增加，到一定程度的時候就會發病。在生產上，可以通過藥劑來控制病毒繁殖，抑制病毒的活性。

而要做到防治和預防，診斷是必不可少的，因此就可以借助農作物病毒檢測儀來開展作物病害的防治工作，從而將農作物病害帶來的農業損失降到最低，同時也可以幫助節約種植成本。